أنشئ المجلس العلمي بجامعة الملك خالد بعد إنشاء الجامعة مباشرة في العام 1419هـ. ومنذ ذلك الحين وهويمارس مهامه المنصوص عليها في نظام مجلس التعليم العالي والجامعات، ومن أبرزها التوصية بتعيين أعضاء هيئة التدريس بالجامعة، والبت في ترقياتهم العلمية، وتشجيع البحث العلمي والتأليف والترجمة والنشر.
تتولى أمانة المجلس العلمي تهيئة أعماله وجدولتها وتنسيق أعمال اللجان الدائمة المنبثقة عنه، ويتبع المجلس العلمي اللجان الدائمة التالية: